Rusia, Austria-Hongaria lan Prusia nahan kemampuan kanggo ngontrol kahanan ing "kutha bebas" lan liwat partisipasi ing badan pamrentah. Kekuwatan legislatif ing Krakow kagungane Majelis Perwakilan, lan eksekutif dileksanakake dening Senat 12 wong. Senat kalebu ora mung utusan saka Majelis Perwakilan lan Universitas Jagiellonian, institusi pendidikan paling wewenang ing Eropah Wétan, nanging uga wakil saka telung negara wali - Kakaisaran Rusia, Austria-Hongaria lan Prusia. Ketua Senat, sanajan miturut konstitusi Krakow ora duwe daya tunggal, ing kasunyatan kang klempakan cukup akèh kakuwasan ing tangan lan wis pengaruh nyata ing pamaréntahan kutha. Stanislav Wodzicki, sing sadurunge nyekel jabatan prefek departemen Krakow, disetujoni kanggo posisi iki. Pencalonan dheweke dilobi dening Adam Jerzy Czartoryski, mantan menteri luar negeri Kakaisaran Rusia, sing duwe pengaruh tartamtu ing politik Polandia.
История otonomi politik jangka pendek Krakow sing relatif cendhak diiringi konfrontasi "pihak" saingan sing makili kepentingan aristokrasi lan "estate katelu".

Kanggo liberal, sing makili kapentingan "estate katelu", mangsa luwih apik saka kutha ketoke minangka pengawetan status republik demokratis kanthi nguatake otonomi luwih. Nanging, senadyan posisi demokratis sing diumumake, para liberal makarya kanthi rapet karo Prusia, sing kasengsem ing perdagangan karo Krakow lan ngarepake pengaruhe politik pemerintah kutha liwat dhukungan saka "partai" liberal.
Ing upaya kanggo mbatesi saingan saka Majelis Perwakilan ing pengaruh nyata ing politik kutha, ketua Senat Vodzitsky njupuk munggah laku ngowahi kanggo kaisar Rusia kanggo dhukungan. Posisi Wodzicki iki nyebabake rasa ora puas umum karo aktivitase minangka kepala Senat. Ing taun 1820, ana demonstrasi massal siswa saka Universitas Jagiellonian, sing ngrusak hubungan antara pimpinan universitas lan ketua Senat. Ing taun 1821, panguwasa nemokake aktivitas organisasi mahasiswa ilegal "Elang Putih", sawise Vodzitsky pribadi nguripake menyang negara wali lan entuk watesan otonomi universitas. Kanthi nindakake iki, dheweke ngarep-arep bisa nyingkirake pesaing sing mbebayani - rektor universitas, Valenty Litvinsky. Nanging demarche kuwi marang universitas, bangga Krakow, mung nyumbang kanggo discrediting final Wodzicki lan politik ing mata saka akèh-akèhé saka pedunung kutha. Ing taun 1826, kontrol kuratorial ditetepake ing universitas, lan Jendral Jozef Załuski ditunjuk kanggo mimpin kurator, sing wiwit "ngresiki" universitas kasebut saka profesor liberal. Ing wektu sing padha, aktivitas Zalussky ing kirim iki ora kudu ditaksir unequivocally - ora mung murub profesor dipercaya, nanging uga ngajak guru saka kutha-kutha liyane kanggo bisa, lan uga mbukak Technical Institute ing Krakow.
Ing taun 1827, Stanislav Vodzitsky kalah ing pemilihan sabanjure kanggo jabatan ketua Senat. Yuzef Nikorovich, sing sadurunge wis dadi ketua Pengadilan Banding lan dianggep minangka juru wicoro kanggo kapentingan "estate katelu" lan wong saka views liberal, kapilih kanggo posisi iki. Iki acara ora bisa gawe marem elit konservatif Krakow, minangka asil saka "aristokrat" ninggalake sesi Senat. Perwakilan negara-negara wali campur tangan ing wiwitan krisis politik, lan mrentah Stanisław Wodzicki tetep dadi ketua Senat, lan Majelis Perwakilan dibubarake. Mangkono, jotosan pisanan ditindakake kanggo otonomi nyata Republik Krakow.
Ing taun 1828, kanthi inisiatif para diplomat Rusia, Komite Epurasi digawe, kalebu Stanislav Vodzitsky dhewe lan telu senator pro-Rusia liyane. Vodzicki, kanthi dhukungan saka Rusia, nindakake kabeh kanggo mbusak politisi liberal-minded, kalebu profesor saka Universitas Jagiellonian, saka melu ing manajemen "kutha free". Kawicaksanan kaya Wodzicki kanthi marem kapentingan Kakaisaran Rusia, sing ngupayakake kontrol sing luwih ketat ing Krakow. Petersburg ngerti banget yen Krakow ora tiba ing wilayah pengaruh Rusia, banjur cepet utawa mengko bakal ana ing kontrol Prusia, utawa minangka bagéan saka Austria-Hongaria.
Nalika ing Nopember 1830 ana pambrontakan populer ing Karajan Polandia, gerakan nasional uga diwiwiti ing Krakow. Kaping pisanan, "kutha bebas" dadi pusat utama dhukungan eksternal kanggo para pemberontak ing Kerajaan Polandia, lan banjur pambrontakan nyebar menyang Krakow. Para radikal enom sing dipimpin Jacek Hudrayczyk nangkep Stanisław Wodzicki lan meksa dheweke ninggalake Krakow.

Pemberontakan November lan perang sing dawa nglawan para pemberontak nyumbang kanggo ngencengi kebijakan Kakaisaran Rusia lan Austria-Hongaria menyang Republik Krakow. Panguwasa Rusia dadi kuciwa karo elit Krakow, sing nalika pemberontakan ndhukung para pemberontak. Ngelingi yen ing wektu iki hubungan sekutu wis ana antarane Rusia, Prusia lan Austria-Hongaria, pangaturan digawe ing distribusi pengaruh saka telung negara. Kakaisaran Rusia nyerahake prioritas ing kontrol Republik Krakow menyang Austria-Hongaria. Tanggal 14 Oktober 1835, ing Berlin, wakil Rusia, Prusia lan Austria-Hongaria nandatangani dokumen rahasia, miturut Republik Krakow tundhuk pendhudhukan yen ana aktivasi gerakan pembebasan nasional Polandia ing kono. Mesthine nransfer meh kabeh wilayah Republik Krakow menyang Austria-Hongaria, sing saiki, yen ana kahanan sing tambah parah, bakal dadi peran penting kanggo nggawe "tatanan" ing wilayah Krakow lan saubengé.
Ing taun 1836, pasukan saka negara wali digawa maneh menyang Krakow. Alesan kanggo iki yaiku pembunuhan agen Rusia Begrens-Pavlovsky dening nasionalis Polandia. Sanadyan, ing tekanan saka Inggris lan Prancis, Rusia lan Prusia pungkasane mundur saka formasi militer saka Krakow, tentara Austro-Hungaria tetep ana ing Republik Krakow nganti 1841. Komando Austro-Hungaria, kanthi partisipasi perwira Rusia lan Prusia, wiwit nyusun ulang polisi lan milisi (milisi) Krakow. Wong-wong sing setya marang negara-negara wali ditunjuk kanggo posisi komando lan pimpinan ing struktur kekuwatan "kutha bebas". Polisi dipimpin dening perwira Austria Hohfeld, lan polisi dening perwira Austria Frantisek Gut.
Liwat tangan polisi sing dianyarake, Austria-Hongaria nggawe rezim polisi sing ketat ing Republik Krakow. Nanging, Inggris lan Prancis terus nuntut saka Austria-Hongaria penarikan pasukan saka wilayah Republik Krakow lan netepi pancasan saka Kongres Wina. Pungkasane, tanggal 21 Fèbruari 1841, Wina mènèhi prentah marang wadyabalané supaya lunga saka Krakow. Nanging sanajan pasukan Austria-Hongaria mundur, kekuwatan nyata ing kutha kasebut tetep ana ing tangan para politisi pro-Austria, sing gumantung marang polisi kutha sing diatur maneh dening Austria.

Kahanan ing Krakow babar pisan ora gawe marem para nasionalis Polandia, sing ngupaya mulihake negara Polandia sing merdika. Kaya ing wilayah Polandia liyane, kelompok pembebasan nasional bawah tanah terus beroperasi ing Krakow. Ing Januari 1846, Dewan Nasional Republik Polandia digawe, kalebu Karol Liebelt, Jan Tyssowski lan Ludwik Gozhkowski. Ing pimpinane, patriot Polandia mesthine ngunggahake pambrontakan liyane, nanging panguwasa Rusia lan Prusia bisa nyegah para pemberontak lan bisa nangkep bagean penting saka konspirator sanajan sadurunge wicara diwiwiti. Mangkono, pemberontakan mung diwatesi ing wilayah Republik Krakow. Kawiwitan ing dalu tanggal 21-22 Fèbruari 1846. Pertempuran jalanan wiwit ing Krakow, minangka asil saka detasemen Austria cilik sing mlebu kutha kasebut dipeksa ninggalake wilayah kasebut. Bentrokan karo pasukan Austria uga diwiwiti ing sekitar Krakow, detasemen pemberontak Polandia saka pemukiman liyane dikirim menyang kutha.
22 Fèbruari 1846 Krakow dibébasaké babar pisan saka pasukan Austria. Pamrentahan Polandia diadegake ing kutha kasebut, dipimpin dening Jan Tyssovsky, politisi nasionalis Polandia, veteran pemberontakan taun 1830-1831. Ing 24 Februari, Tyssovsky nyatakake dheweke minangka diktator nasional, lan sijine kanca-in-arms Ludwik Gozhkovsky ing kepala pamaréntahan.

Senadyan plans grandious, amarga lack of gaman, pemberontakan kasebut wiwitane bakal gagal. Tanggal 26 Fèbruari 1846, siji-sijine paprangan gedhé wadyabala Austria ing sangisoré komando Kolonèl Lajos von Benedek (ing potret) kelakon karo para pemberontak Krakow. Wigati dimangerteni yen wong tani ing desa-desa ing saubengé metu ing sisih Austria.

Tanggal 3 Maret 1846, pasukan ekspedisi Rusia mlebu Krakow, dipimpin dening jenderal kavaleri lan ajudan jenderal Fyodor Ridiger, sing mrentah Korps Infanteri III. Nanging, Kakaisaran Rusia wis suwe mutusake kanggo nransfer kabeh kekuwatan Krakow menyang Austria-Hongaria. Mulane, ing 3 Maret 7, pasukan Austro-Hungaria mlebu kutha. Jendral Austria Count Castiglione ngrebut kutha kasebut saka komando Rusia. Senat Krakow ora ana, lan administrasi kutha kasebut ditransfer menyang tangan Dewan Administratif sing mentas dibentuk.
Tanggal 15 April 1846, wakil saka negara-negara wali ketemu ing Wina, ing ngendi persetujuan ditandatangani babagan transfer Krakow lan wilayah-wilayah ing saubengé ing kontrol Austria-Hongaria. "Kutha Bebas" diowahi dadi Kadipaten Agung Krakow minangka bagéan saka Kakaisaran Austro-Hungaria. Senadyan protes saka Inggris lan Prancis, penghentian saka "kutha bebas Krakow" dadi kasunyatan. Tanggal 16 Nopember 1846, pungkasané kalebu ing Kakaisaran Austro-Hongaria lan tetep dikuwasani Austria-Hongaria nganti kalah ing Perang Donya I lan mungkasi eksistensi. Nanging, telung puluh taun eksistensi "kutha bebas Krakow" dadi kaca khusus ing sajarah Polandia sajrone pemisahan kasebut.